Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms