Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms