Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Thbs2Q03350 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Thbs2Q03350 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Thbs2Q03350 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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