Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms