Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GscQ02591 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GscQ02591 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GscQ02591 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms