Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RykQ01887 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
RykQ01887 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RykQ01887 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RykQ01887 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RykQ01887 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RykQ01887 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RykQ01887 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RykQ01887 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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RykQ01887 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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RykQ01887 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RykQ01887 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms