Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col1a2Q01149 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms