Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms