Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scn1bP97952 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms