Protein–RNA interactions for Protein: P97477

Aurka, Aurora kinase A, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkaP97477 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkaP97477 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkaP97477 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
AurkaP97477 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkaP97477 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkaP97477 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms