Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms