Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Tp53bp1P70399 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Tp53bp1P70399 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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