Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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