Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chl1P70232 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chl1P70232 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chl1P70232 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chl1P70232 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms