Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf5P70191 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf5P70191 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf5P70191 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf5P70191 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf5P70191 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf5P70191 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf5P70191 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf5P70191 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf5P70191 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf5P70191 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf5P70191 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf5P70191 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf5P70191 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf5P70191 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf5P70191 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Traf5P70191 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf5P70191 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf5P70191 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf5P70191 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Traf5P70191 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf5P70191 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf5P70191 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf5P70191 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf5P70191 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf5P70191 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf5P70191 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf5P70191 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf5P70191 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf5P70191 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf5P70191 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf5P70191 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Traf5P70191 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Traf5P70191 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms