Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab3cP62823 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms