Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Snrpd3P62320 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms