Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Taf13P61216 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Taf13P61216 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Taf13P61216 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Taf13P61216 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Taf13P61216 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Taf13P61216 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Taf13P61216 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Taf13P61216 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Taf13P61216 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Taf13P61216 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Taf13P61216 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Taf13P61216 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf13P61216 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms