Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P58686 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P58686 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P58686 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P58686 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P58686 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P58686 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P58686 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P58686 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P58686 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P58686 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P58686 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P58686 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P58686 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P58686 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P58686 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P58686 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P58686 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P58686 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P58686 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P58686 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
P58686 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P58686 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P58686 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P58686 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
P58686 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P58686 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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P58686 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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P58686 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P58686 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P58686 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P58686 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P58686 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P58686 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P58686 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P58686 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P58686 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P58686 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P58686 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P58686 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P58686 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P58686 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P58686 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P58686 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P58686 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P58686 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P58686 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P58686 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P58686 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P58686 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P58686 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms