Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms