Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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