Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NcanP55066 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NcanP55066 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NcanP55066 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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