Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Rad23bP54728 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rad23bP54728 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rad23bP54728 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad23bP54728 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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