Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TspoP50637 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TspoP50637 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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