Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FmodP50608 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FmodP50608 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms