Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rfx1P48377 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rfx1P48377 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rfx1P48377 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rfx1P48377 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rfx1P48377 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rfx1P48377 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rfx1P48377 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rfx1P48377 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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