Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VdrP48281 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VdrP48281 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VdrP48281 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VdrP48281 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VdrP48281 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VdrP48281 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VdrP48281 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VdrP48281 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
VdrP48281 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VdrP48281 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VdrP48281 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VdrP48281 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VdrP48281 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VdrP48281 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VdrP48281 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VdrP48281 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VdrP48281 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VdrP48281 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VdrP48281 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VdrP48281 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VdrP48281 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VdrP48281 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VdrP48281 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VdrP48281 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VdrP48281 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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