Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LtbP41155 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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LtbP41155 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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LtbP41155 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
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LtbP41155 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LtbP41155 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
LtbP41155 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LtbP41155 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
LtbP41155 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LtbP41155 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LtbP41155 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LtbP41155 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LtbP41155 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LtbP41155 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LtbP41155 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LtbP41155 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LtbP41155 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtbP41155 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtbP41155 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LtbP41155 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms