Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Rpl28P41105 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms