Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
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Rab5cP35278 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Rab5cP35278 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Rab5cP35278 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Rab5cP35278 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Rab5cP35278 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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