Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp4P35123 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp4P35123 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms