Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms