Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Cenpk-202ENSMUST00000070761 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm29329-201ENSMUST00000189053 621 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 AC156790.4-202ENSMUST00000228838 1418 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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