Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pabpc1P29341 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms