Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms