Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxraP28700 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxraP28700 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxraP28700 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxraP28700 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxraP28700 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxraP28700 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RxraP28700 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxraP28700 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RxraP28700 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxraP28700 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RxraP28700 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxraP28700 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxraP28700 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxraP28700 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RxraP28700 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxraP28700 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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