Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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