Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChgaP26339 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChgaP26339 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChgaP26339 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChgaP26339 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms