Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NdnP25233 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NdnP25233 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NdnP25233 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NdnP25233 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NdnP25233 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
NdnP25233 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NdnP25233 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NdnP25233 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
NdnP25233 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NdnP25233 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
NdnP25233 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NdnP25233 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NdnP25233 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NdnP25233 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NdnP25233 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NdnP25233 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NdnP25233 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NdnP25233 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NdnP25233 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NdnP25233 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NdnP25233 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NdnP25233 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NdnP25233 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NdnP25233 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NdnP25233 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NdnP25233 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NdnP25233 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NdnP25233 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
NdnP25233 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NdnP25233 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NdnP25233 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms