Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxd8P23463 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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