Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
P20040 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
P20040 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
P20040 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P20040 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
P20040 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P20040 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
P20040 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P20040 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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P20040 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P20040 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P20040 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P20040 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
P20040 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P20040 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P20040 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P20040 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P20040 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P20040 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P20040 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P20040 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P20040 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P20040 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P20040 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P20040 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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P20040 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P20040 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
P20040 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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P20040 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P20040 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
P20040 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P20040 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P20040 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P20040 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P20040 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P20040 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P20040 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
P20040 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P20040 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
P20040 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P20040 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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P20040 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
P20040 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
P20040 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P20040 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P20040 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
P20040 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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P20040 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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P20040 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P20040 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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P20040 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P20040 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P20040 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P20040 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
P20040 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
P20040 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
P20040 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
P20040 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
P20040 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
P20040 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
P20040 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
P20040 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
P20040 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
P20040 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
P20040 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
P20040 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P20040 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
P20040 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P20040 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P20040 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P20040 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
P20040 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P20040 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P20040 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
P20040 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
P20040 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P20040 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
P20040 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
P20040 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
P20040 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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