Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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