Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18524 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18524 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18524 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18524 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18524 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18524 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18524 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18524 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18524 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18524 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18524 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18524 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18524 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18524 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18524 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18524 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18524 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18524 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18524 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18524 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18524 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18524 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18524 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18524 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18524 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18524 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18524 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18524 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18524 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18524 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18524 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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