Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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PcnaP17918 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcnaP17918 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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PcnaP17918 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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PcnaP17918 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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PcnaP17918 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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PcnaP17918 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcnaP17918 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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PcnaP17918 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms