Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gabra6P16305 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms