Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DmdP11531 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DmdP11531 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DmdP11531 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DmdP11531 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DmdP11531 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DmdP11531 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DmdP11531 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DmdP11531 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DmdP11531 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DmdP11531 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DmdP11531 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DmdP11531 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DmdP11531 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DmdP11531 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DmdP11531 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DmdP11531 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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DmdP11531 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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DmdP11531 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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DmdP11531 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DmdP11531 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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