Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Col4a5-201ENSMUST00000112930 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Itgam-201ENSMUST00000064821 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Pcdh15-216ENSMUST00000131724 6322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Plec-208ENSMUST00000080857 14959 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ndufb1P0DN34 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms