Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms