Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12□□□□□ -0.49
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Tgfb1P04202 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Tgfb1P04202 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Tgfb1P04202 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Tgfb1P04202 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Tgfb1P04202 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Tgfb1P04202 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfb1P04202 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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