Protein–RNA interactions for Protein: P01728

Ig lambda-2 chain V region, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01728 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01728 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01728 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01728 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01728 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01728 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01728 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01728 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01728 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01728 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01728 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01728 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01728 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01728 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01728 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01728 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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